Фамилия Крестовников — редкий случай, когда прозрачная, казалось бы, основа («крест») скрывает не один, а целых три возможных пути происхождения, и выбор между ними зависит от того, кем был конкретный предок.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ов (притяжательный, «чей?») прирос к основе «Крестовник», которая, в свою очередь, образована от существительного «крест» с помощью суффикса -ник. Фамилия — типично семинарская по форме (как Троицкий, Рождественский), но по сути может быть и мирской.

Первая версия — самая очевидная и массовая: фамилия дана по названию церковного праздника или храма. «Крестовник» — это устаревшее название Крестовоздвиженской церкви (в честь Воздвижения Креста Господня). Священник, служивший в таком храме, или его сын вполне мог получить фамилию Крестовников. Это искусственная, «церковная» фамилия, каких много в среде духовенства.

Вторая версия — прозвищная, бытовая. В русских говорах «крестовником» называли не только растение (крестовник обыкновенный), но и человека, который носил на себе крест — например, старообрядца, строго соблюдавшего обычай носить нательный крест поверх одежды, или паломника, возвращавшегося с поклонения из Иерусалима. Такое прозвище могло закрепиться за человеком из крестьянской или купеческой среды, и уже от него пошла фамилия.

Третья, менее распространенная версия — топонимическая. Существовали деревни с названием Крестовники (например, в бывшей Вятской губернии). Выходец из такой деревни получал прозвище Крестовник, а его дети становились Крестовниковыми.

Интересно, что фамилия Крестовников зафиксирована в разных сословиях. С одной стороны, это известная купеческая династия (Крестовниковы — крупные промышленники и банкиры XIX века), чья фамилия, скорее всего, восходит к прозвищу или названию местности. С другой — множество носителей среди духовенства, где фамилия образована от храма. Таким образом, Крестовников — это фамилия-двойник: звучит одинаково, но предки разных людей могли быть и поповичами, и купцами, и крестьянами.