Фамилия Крохинова — женская форма от Крохинов, и её разбор стоит начать с суффикса. Модель на -инов(-а) встречается реже, чем массовые -ов и -ин, и указывает на притяжательное значение: «чей?» — Крохинов, то есть сын или потомок человека по прозвищу Кроха, Крохин. Суффикс -ин- в данном случае не первичен: основа Крох- сначала получила суффикс -ин, образуя прозвище Кроха (маленький, незначительный человек), а затем к этой основе добавили -ов, что усилило патронимический оттенок. Такое наслоение суффиксов характерно для поздних фамилий, когда старые формы на -ин уже не воспринимались как отчества и требовали уточнения.

Корень фамилии — «крох-» от слова «кроха» (малыш, крошка, нечто малое). В русских говорах «кроха» означало не только ребёнка, но и скупого, мелочного человека, а также мелкую монету или долю. В ономастике известна фамилия Крохин (по словарю Б. Унбегауна, от прозвища Кроха), и Крохинова — её производная форма. Прямой параллели с «крошить» или «крохобор» здесь нет, хотя народная этимология могла связывать прозвище с человеком, который «крошит» (работает с мелкими деталями, например, резчик по дереву или портной).

Географически фамилия Крохинова тяготеет к южнорусским и центральным областям, особенно к Курской, Воронежской и Рязанской губерниям, где распространены фамилии с суффиксом -инов. Встречается и вариант Крохинова с ударением на второй слог (Кро́хинова), что реже, чем Крохино́ва. В дореволюционных записях можно найти Крохиновых среди крестьян и однодворцев — сословия, которое часто носило фамилии с характерными суффиксами, образованными от прозвищ.

У фамилии есть интересная особенность: она могла возникнуть не напрямую от прозвища, а от названия деревни или села. В исторических документах встречаются топонимы вроде Крохина (например, в бывшей Орловской губернии). Тогда Крохинов — это «выходец из Крохина», а суффикс -ов добавили по модели фамилий от названий поселений, что делает её одновременно и географической, и прозвищной.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Крохин, Крохинцев, Крохинский — показывает, что Крохинов(а) стоит особняком: она не так частотна, как Крохин, но встречается чаще, чем Крохинцев. Носительница фамилии Крохинова может быть уверена: её предок, скорее всего, был человеком невысокого роста или имел прозвище за скромность, либо жил в местности, названной в честь такого человека.