Фамилия Крохта звучит компактно, но за ней стоят как минимум три версии происхождения, и все они связаны с идеей малости, хрупкости или нежности.

Самая прямая линия ведет к украинскому слову «крихта» — «крошка». Вряд ли такое прозвище давали взрослому мужчине за рост или фигуру: скорее, это внутрисемейное, ласкательное имя для самого младшего ребенка. В старину подобные прозвища (Малыш, Кроха, Крошка) были распространены, и они легко закреплялись за человеком на всю жизнь, переходя затем в фамилию. Так что вполне вероятно, что родоначальник Крохт был младшим сыном, «крохой» в семье, и это обращение закрепилось за ним.

Вторая версия тоже отталкивается от внешности, но уже не от возраста, а от роста. Если человека называли Крохтой, могли иметь в виду его невысокую фигуру. Такие прозвища по физическим признакам — одна из самых старых и естественных традиций в народной ономастике.

Третий вариант уводит в белорусский язык, где есть слово «крохкі» — «хрупкий, ломкий». Здесь акцент смещается с размеров на телосложение или здоровье. Крохтой могли назвать человека слабого, болезненного, с хрупкой костью. В этом случае фамилия — не характеристика роста, а указание на конституцию.

Какую бы версию ни принять, ясно одно: фамилия Крохта образована без типичных русских суффиксов -ов, -ин, -ский, что для украинской и белорусской традиции нормально. Фамилия осталась в форме чистого прозвища, без дополнительного оформления. Искать её носителей стоит прежде всего в западных и юго-западных регионах бывшей Российской империи — на Украине, в Белоруссии, на прилегающих территориях России.