Фамилия Крупиткина — это женская форма, мужской вариант — Крупиткин. В основе лежит не ремесло и не географическое название, а прозвище или мирское имя, связанное с мелким предметом. Словообразовательная модель здесь простая: к основе «крупитк-» добавлен типичный русский фамильный суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Крупитки). Суффикс -к- в основе — уменьшительный, то есть исходное прозвище было Крупитка.

Само слово «крупитка» — это уменьшительное от «крупица», «крупка», то есть очень маленькая частица, крошка. В старину такое прозвище могли дать человеку маленького роста, щуплому телосложению или, напротив, тому, кто был дотошным, придирчивым к мелочам. Есть и другая, менее вероятная версия: связь с названием блюда — крупяной каши. В некоторых говорах «крупиткой» называли особо мелкую крупу или остатки крупы после просеивания. В этом случае прозвище могло закрепиться за мельником или торговцем крупой.

По географии фамилия Крупиткин редкая, встречается в основном в центральных и северных областях России — в Костромской, Вологодской, Ярославской губерниях. В этих местах была сильна традиция мирских имён, и прозвища от мелких предметов давали часто, чтобы уберечь ребёнка от сглаза: «маленький» значило «незаметный для злых сил». Так что предок носителя фамилии, скорее всего, был крестьянином, получившим прозвище Крупитка, а его потомки стали Крупиткиными.

Однокоренные фамилии — Крупин, Крупицын, Крупинов — встречаются чаще, но Крупиткин выделяется именно уменьшительным суффиксом, который придаёт прозвищу оттенок ласкательности или пренебрежения. В документах XVII–XVIII веков такая форма встречается редко, что подтверждает её локальный, «домашний» характер. Фамилия не дворянская, не княжеская — она из крестьянской или посадской среды, где прозвища были живыми и конкретными.