Фамилия Крупинина образована от прозвища Крупа, а точнее — от формы Крупина. В основе лежит слово «крупа», но его значение в прозвище неоднозначно. Самая распространённая версия: крупой в народе насмешливо называли солдата, особенно отставного, — вероятно, из-за скудного пайка или грубой, «крупной» натуры. Однако есть и другая, более мягкая трактовка: Крупой или Крупкой могли прозвать маленького ребёнка, поскольку это слово выступало аналогом современного «кроха». Так что предки носителей фамилии могли быть как бывалыми служивыми, так и людьми невысокого роста или хрупкого телосложения.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Крупинин — это «сын Крупины». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ или имён, оканчивающихся на -а или -я. Интересно, что фамилия Крупинина встречается и в мужском (Крупинин), и в женском варианте, причём женская форма закрепилась как основная в документах, что бывает реже. Географически фамилия рассредоточена, но чаще попадается в центральных и северных областях России, где слово «крупа» в бытовой речи было особенно ходовым.

Сравните с однокоренными фамилиями: Крупенин, Крупкин, Крупин. Они образованы от тех же корней, но с разными суффиксами. Крупинина стоит особняком — двойной суффикс (-ин-ин) здесь редок и мог возникнуть либо из формы Крупина (как отчество от прозвища), либо как вариант фамилии Крупин, к которому добавили ещё один -ин для различения ветвей рода. Так что если вы носите фамилию Крупинина, ваши предки почти наверняка были крестьянами или посадскими людьми: прозвища такого типа редко встречались у дворян, которые чаще брали фамилии по землям или службе.