Фамилия Куанышюеков — редкий случай в русском ономастиконе, где тюркская основа соединилась с русским патронимическим суффиксом -ов. Её ядро — казахское имя Куаныш, которое переводится как «радость» или «счастье». В казахской традиции имена с таким корнем (Куаныш, Куанышбек) давали ребёнку, рождение которого стало долгожданным событием или принесло утешение после утраты. Вторая часть — «юек» — скорее всего, искажённое при транслитерации «жүйек» (казах. «ряд», «линия») или же вариант арабского «уак» (время, эпоха), но надёжнее всего объяснять её как составную часть сложного имени, где «-юек» — это усечённая форма от «жүрек» (сердце). Таким образом, Куанышюеков может означать «радостное сердце» или «счастливый по духу».

Словообразовательная модель типична для русифицированных фамилий народов Средней Азии и Казахстана: к тюркскому личному имени добавляют русский суффикс принадлежности -ов, указывающий на потомка. Встречаются варианты написания — Куанышюков, Куанышуеков, — что связано с разной передачей казахских звуков через кириллицу. Фамилия почти не встречается за пределами Казахстана и прилегающих регионов России (Оренбургская, Астраханская области), где исторически жили казахи, принявшие православие или перешедшие на русскую документацию в XIX–XX веках.

Социально предки носителя фамилии, скорее всего, были скотоводами или крестьянами-казахами, чьи имена при переписях и паспортизации записывали по-русски. В отличие от фамилий знатных тюркских родов (с суффиксами -беков, -султанов), Куанышюеков — «народная» фамилия, образованная от распространённого имени без указания на сословие. Встречается она редко: по открытым данным, в России её носят не более нескольких десятков человек, в основном в Западном Казахстане.