Фамилия Кубани — редкий случай, когда географическое название перешло в фамилию почти без изменений, сохранив исходную форму. В русской ономастике такие фамилии встречаются нечасто: обычно топонимы обрастали суффиксами (Кубанцев, Кубанский) или меняли окончание. Здесь же мы видим чистую основу — Кубани. Это могла быть и украинская модель, где фамилии на -и не редкость (Донецки, Черкаси), но в русском контексте такая форма указывает на родительный падеж: «с Кубани», «из Кубани».

Скорее всего, фамилию дали человеку, который пришёл с реки Кубань или с Кубани как региона. В XIX веке, после заселения кубанских земель, переселенцев часто записывали по месту выхода: «Кубанец» или «Кубанский». Форма Кубани могла закрепиться в документах как прозвище — «он тот самый, что с Кубани». Другая версия, менее вероятная, — от тюркского личного имени Кубан (у некоторых народов Кавказа), но тогда фамилия скорее имела бы вид Кубанов.

Словообразовательная модель простая: географическое название в чистом виде. Суффикса нет — это редкий для русских фамилий нулевой способ, когда топоним становится фамилией путём перехода в разряд имён собственных. В украинских и белорусских фамилиях такое встречается чаще (Житомир, Харьков), а в русском — скорее исключение.

География фамилии узкая. Встречается она преимущественно на юге России — в Краснодарском крае, Ростовской области, а также среди потомков кубанских казаков, переселившихся в другие регионы. В центральной России фамилия практически не бытует, что подтверждает её локальное происхождение.

Социальный контекст прост: предки носителя фамилии — скорее всего, казаки или крестьяне-переселенцы, осваивавшие Прикубанье в XVIII–XIX веках. Фамилия не дворянская, не купеческая — это бытовое прозвище, закрепившееся в документах при переписях или записях в церковных книгах. Если искать параллели, то Кубани стоит в одном ряду с фамилиями Волги, Дона, Урала — все они указывают на человека, связанного с определённой рекой или регионом.