Фамилия Кубановы (в мужском варианте — Кубанов) в своей основе имеет прозвище Кубан. В казачьей среде так называли большую крынку, а в орловских говорах — «ситный хлеб». Отсюда две бытовые версии происхождения: либо предок был пекарем, который пек сдобный хлеб, либо гончаром, делавшим крынки. Обе версии укладываются в модель, когда фамилию давали по ремеслу или предмету обихода, с которым человека связывала работа.

Но есть и третье, более вероятное, объяснение. Прозвище Кубан мог получить полный человек — по ассоциации с округлой формой той же крынки или каравая. Такие прозвища по внешним признакам были очень распространены на Руси. Словообразовательная модель проста: к основе Кубан- добавили типичный русский суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — Кубанов, то есть сын или потомок Кубана).

Фамилия входит в число так называемых «патронимических» (образованных от имени или прозвища отца) и распространена в южных регионах России, особенно среди потомков казачества. Примечательно, что у фамилии нет географической привязки к реке Кубань — это случайное внешнее созвучие, хотя в народной этимологии их иногда путают. О точном времени возникновения говорить сложно: процесс закрепления фамилий у крестьян и казаков растянулся на несколько столетий, но в документах XVI–XVII веков прозвище Кубан уже встречается.