Фамилия Кубашева — женская форма фамилии Кубашев. В её основе лежит тюркское имя Кубаш, которое до сих пор бытует у татар и башкир. Значение этого имени неоднозначно, и лингвисты предлагают три основные версии его происхождения.

Первая, самая прямая версия, связывает имя Кубаш с названием птицы. В ряде тюркских языков «куба» означает лебедя или пеликана, так что прозвище могло указывать на внешность или характер человека — стать, белизну кожи или спокойный нрав.

Вторая гипотеза разбивает имя на две части: «куба» (бледно-бурый, светлый) и «иш» (друг, ровня, пара). В таком случае Кубаш — это сложносоставное имя со значением «светлый друг» или «достойный товарищ». Подобные двухосновные имена (например, Кубаиш) характерны для древней тюркской антропонимии.

Третья версия отталкивается от турецкого глагола kubaşmak — «делать что-либо сообща, помогать друг другу». Если это так, то имя Кубаш могло быть пожелательным: родители называли так сына в надежде, что он вырастет надёжным помощником и товарищем.

Фамилия образована по стандартной русской модели с суффиксом -ев, который присоединяется к основам на шипящий или мягкий согласный (Кубаш → Кубашев). Суффикс указывал на принадлежность: «сын Кубаша». Женская форма Кубашева означает «дочь или жена Кубаша».

Точное время и место возникновения рода Кубашевых без генеалогических изысканий не определить. Фамилия могла появиться где угодно на территории расселения тюркских народов — от Поволжья до Урала, а затем и в других регионах России. Судя по корню, предки Кубашевых с высокой вероятностью были тюркоязычными (татарами, башкирами или чувашами), но сама фамилия — результат русской делопроизводственной традиции XVI–XVII веков, когда имена инородцев фиксировали в документах с патронимическими суффиксами.