Фамилия Кубинцевы — один из тех случаев, когда фамилия говорит о месте, откуда родом её первый носитель. В основе лежит прозвище Кубинец, а оно, скорее всего, указывает на выходца из деревни Кубино. Такая деревня действительно существует — в Череповецком районе Вологодской области. Модель образования простая и типичная для северных и центральных областей России: сначала прозвище по названию местности (Кубинец), а затем фамилия с патронимическим суффиксом -ев: Кубинцев, то есть «сын Кубинца».

С происхождением самого топонима Кубино всё не так однозначно. Есть две основные версии, и обе имеют право на существование. Первая — славянская: от слова «куб», которое в старых говорах могло означать не только геометрическую фигуру, но и меру сыпучих тел, кадушку или даже небольшой, округлый холм. Если деревня стояла на таком холме или у речного затона, похожего на куб, название могло закрепиться по чисто внешнему признаку.

Вторая версия — тюркская. Она связывает название с личным именем Кубай, которое в тюркских языках означает «бледно-бурый», «светло-гнедой» (обычно о масти лошади). Это имя могло остаться в ономастиконе северных территорий ещё со времён активных контактов славянского и тюркского населения. В таком случае название деревни произошло от имени первопоселенца или землевладельца.

Обе версии правдоподобны, но славянская (от «куб» как холм или мера) выглядит чуть естественнее для вологодских мест: в этих краях много топонимов, образованных от особенностей ландшафта и бытовых предметов.

Фамилия Кубинцев — не очень частая, что тоже говорит в пользу её чёткой географической привязки. Она не разошлась широко по стране, а осталась в основном в тех регионах, откуда пошли её первые носители — на Русском Севере и в прилегающих областях. Процесс формирования фамилий здесь был долгим, и точно сказать, в каком веке конкретный Кубинец стал Кубинцевым, сейчас сложно. Но сама фамилия — хороший пример того, как прозвище, данное по месту жительства, закрепилось в роду и дошло до наших дней.