Фамилия Кубка — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не профессия, а, скорее всего, прозвище, связанное с мерой объёма. В старину «кубка» — это уменьшительное от «куб», то есть сосуд для питья, кружка или ковш. Человек мог получить такое прозвище за любовь к выпивке, за то, что держал на постоялом дворе мерные кружки, или же, наоборот, за пристрастие к точным мерам — например, перекупщик зерна, отмерявший товар «кубками». В любом случае, отсылка к конкретному бытовому предмету, а не к абстрактному признаку.

Словообразовательная модель здесь нестандартная. Фамилия оформлена не привычными суффиксами -ов, -ин или -ский, а сохранила форму самого прозвища в именительном падеже — Кубка. Это характерно для украинской, белорусской или южнорусской традиции, где фамилии часто не склонялись по модели «чей?» (чей сын? — Кузнецов), а фиксировали прозвище как есть. В русском ономастиконе такие фамилии встречаются реже, и Кубка стоит в одном ряду с Шуба, Кочерга, Сковорода.

Географически фамилия тяготеет к западнорусским и украинским землям. В переписях XVII–XVIII веков носители фамилии Кубка встречаются среди казаков Черниговщины и Полтавщины, а также среди крестьян Смоленской губернии. В польских метриках попадается вариант Kubka — с тем же значением, но уже как фамилия мещанского или шляхетского происхождения, иногда от имени Якуб (через стяжение Якубка > Кубка).

Вторая, менее вероятная версия связывает фамилию с тюркскими корнями: в некоторых тюркских языках «кубка» — разновидность шапки или головного убора. Но для славянской ономастики эта гипотеза спорна: прозвище от посуды встречается повсеместно, а от головного убора — единично и только в зонах активных контактов с кочевниками.

В современной России фамилия Кубка остаётся малочисленной. Она не дала громких династий, и её носители — это, скорее всего, потомки тех самых «кубков»: трактирщиков, мелких торговцев или просто людей с характерной бытовой кличкой, закрепившейся в документах.