Фамилия Кубрин образована от прозвища Кубра. В его основе лежит диалектное слово «кубра», которое в новгородских говорах имеет значение «шалун, шутник, проказник». Поэтому можно предположить, что прозвище Кубра либо носил праздный человек, либо любитель таких пирогов. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Кубра, со временем получил фамилию Кубрин.