Фамилия Куданкин образована от топонима Куданки. Села и деревни с таким названием достаточно широко распространены на территории России и Украины (деревня в Волосовском районе, село в Хмельницкой области и др.). Согласно другой гипотезе, фамилия образована от прозвища Куданка. Оно восходит к тюркскому «кудан» - «серый», «слуга». В таком случае прозвище либо отражало особенности характера и поведения основателя фамилии (заурядный, простой), либо указывало на социальное положение и род занятий предка. В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Куданка, со временем получил фамилию Куданкин.