Фамилия Кухтенкова образована от прозвища Кухта. В его основе лежит либо слово «кухта» — «косматый иней на деревьях», либо новгородский глагол «кухтаться» — «кутаться». Первая версия: Кухтой могли назвать ребёнка, родившегося в морозный зимний день. Вторая: так могли прозвать постоянно мёрзнущего человека, который кутается в тёплую одежду.

Прозвище Кухта известно с XVI века — оно встречается в исторических документах того времени. Сама фамилия Кухтенкова прошла несколько этапов словообразования. Сначала на базе прозвища Кухта сложилась украинская фамилия Кухтенко (с характерным суффиксом -енко, обозначающим потомка). Затем, когда род переехал в Россию, произошла русификация: к украинской основе добавился русский патронимический суффикс -ов, и фамилия окончательно оформилась как Кухтенков (в женском роде — Кухтенкова).

Таким образом, фамилия Кухтенкова отражает сразу два культурных слоя: южнорусскую (украинскую) модель с суффиксом -енко и общерусскую — с суффиксом -ов. Это сравнительно редкий случай двойной адаптации, который указывает на миграцию предков с Украины в великорусские земли.