Фамилия Кукурукина — женская форма от Кукурукин, и её основа звучит настолько ярко, что сразу наводит на мысль о кукурузе. Но в русской ономастике связь с этим растением — лишь одна из версий, и не самая древняя. Кукуруза как культура массово распространилась в России только в XIX–XX веках, а фамилии с корнем «кукур-» фиксируются раньше.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — кукурукин). Основа «Кукурука» — это прозвище или неканоническое имя. В русских говорах «кукурука» могло означать не только початок, но и, например, нечто изогнутое, скрюченное, похожее на крюк. В некоторых диалектах слово «кукурукать» значило «ворковать» или «издавать глухие звуки». Тогда прозвище Кукурука могли дать человеку с тихим голосом, ворчуну или тому, кто сутулился.

Вторая версия, более прозаичная: прозвище от слова «кукурузник» — так в народе называли не только кукурузное поле, но и мелкого торговца или крестьянина, засевавшего поле кукурузой. Но в этом случае фамилия обычно звучала бы как Кукурузников, а не Кукурукин. Поэтому первая версия — от прозвища по внешнему признаку или поведению — выглядит убедительнее.

Географически фамилия редкая. Встречается в южнорусских и украинских регионах, где кукуруза была привычной культурой, но также могла возникнуть в центральной России как прозвищная. Суффикс -ин типичен для фамилий, образованных от слов женского рода или прозвищ на -а/-я, что характерно для северных и центральных областей.

Спорных моментов немного. Однокоренные фамилии — Кукурузов, Кукурузников — встречаются чаще, но Кукурукин стоит особняком. Если предок носил прозвище Кукурука, он мог быть либо слегка горбатым человеком, либо обладателем необычного, «воркующего» голоса. Никаких знаменитых носителей фамилия не имеет, что типично для редких прозвищных фамилий, не попавших в дворянские родословные.