Фамилия Кукурина — женская форма фамилии Кукурин. Её основа — прозвище или нецерковное имя Кукура. В русских говорах «кукура» означало кукурузу, кукурузный початок. В южных и юго-западных регионах, где кукурузу активно выращивали, так могли назвать человека за цвет волос, похожий на золотистый початок, или за крепкое, коренастое телосложение — по аналогии с плотным кочаном. Есть и другая, менее вероятная версия: связь с диалектным глаголом «кукурить» — куковать, то есть грустить или напевать однообразную песню. Но первая версия убедительнее, потому что прозвища по внешности и по сходству с растениями — один из самых распространённых типов в русской ономастике.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Кукурин — «сын Кукуры» или «человек из семьи Кукуры». Такая модель образования типична для фамилий, возникших из прозвищ или имён на -а/-я. Ударение в фамилии падает на второй слог: Куку́рина, что логично для исходного слова «куку́ра».

Фамилия редкая и географически привязана к южнорусским областям — Воронежской, Ростовской, Краснодарскому краю. Встречается также на Урале, куда переселенцы принесли прозвище в XVIII–XIX веках. В дореволюционных документах Кукурины фиксируются в основном как крестьяне и однодворцы — потомки служилых людей, которые охраняли южные границы.

В написании возможны варианты «Кукурен», но форма с -ин устойчивее и встречается чаще. В говорах фамилию могли произносить с твёрдым «р»: Куку́рна, но литературная норма сохраняет полный вариант.