Фамилия Кукус — редкая и неочевидная. В ней нет типичных русских суффиксов -ов, -ин или -ский, поэтому её происхождение сразу вызывает вопросы. Скорее всего, перед нами не исконно русская фамилия, а заимствованная или образованная от прозвища, которое звучало одинаково у разных народов.

Самый прямой путь — от прозвища Кукус. В русских говорах «кукус» могло означать кукушку (звукоподражательное «ку-ку»), но с изменённым окончанием. Такое прозвище давали либо человеку, который часто повторял одно и то же, либо тому, кто напоминал эту птицу повадками или голосом. Однако есть и другая, более вероятная версия: фамилия могла прийти из финно-угорских языков. В карельском и вепсском «kukku» означает «петух», а в некоторых диалектах — «вершина», «холм». Если предок жил на севере или северо-западе России (например, в Олонецкой губернии или Карелии), прозвище Кукус могло относиться к месту жительства — на возвышенности — или к характеру: бойкий, задиристый, как петух.

Фамилия не получила распространения по всей стране. Встречается она точечно: в Прибалтике (особенно в Латвии и Эстонии, где есть фамилия Kukus), на северо-западе России и изредка в Сибири — возможно, в результате переселений. В польском и украинском контексте «kukus» могло быть искажением от «kukułka» (кукушка) или от личного имени Кукуш (уменьшительное от Константин или Кузьма), но для фамилии Кукус это менее характерно.

Словообразовательная модель проста: основа Кукус без дополнительных суффиксов. Такие «голые» фамилии в русской традиции редки и чаще всего указывают на недавнее происхождение — например, когда прозвище записали в документах без изменений. В отличие от фамилий на -ов, которые массово оформлялись в XV–XVII веках, Кукус могла закрепиться позже, в XVIII–XIX веках, среди крестьян или мещан, где прозвища фиксировали «как слышали».

Сравните с однокоренными: Кукушкин (от кукушки, массовая фамилия), Кукуев (от прозвища Кукуй — крикливый), Куксов (от кукс — кулак, но это другое). Кукус стоит особняком: без суффикса, короткая, звонкая. Если ваши предки носили эту фамилию, стоит поискать в метрических книгах западных губерний или Прибалтики — там она встречается чаще, чем в центральной России.