Возможно, фамилия Кукуев имеет в своей основе глагол «куковать» – «жить бедно», а также «проживать свои дни». Скорее всего, предок человека с такой фамилией прожил долгую, но не очень насыщенную событиями жизнь. Согласно другой версии, фамилия Кукуев происходит от диалектного значения этого глагола – «ласкаться, миловаться». В этом случае Кукуем называли любимого сына. Однако нельзя также исключить, что прозвище Кукуй получил ребенок, родившийся в день Ивана Купалы, который раньше называли кокоем или кукуем. Веселовского записан Кукуев Ульян, крестьянин, 1564 г., Олонец. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Кукуй, со временем получил фамилию Кукуев.