Фамилия Кулипанова — женская форма фамилии Кулипанов, и её разбор стоит начать с неочевидного, но ключевого момента: суффикс -анов встречается в русских фамилиях заметно реже, чем стандартные -ов или -ин. Это сразу подсказывает, что основа здесь не типичное русское имя или прозвище на -а, -я (как Кулипа вместо Кулипанов). Скорее всего, перед нами вариант фамилии, образованной от прозвища или имени, которое оканчивалось на согласный, но при этом не было «чисто» русским по звучанию. В ономастике такие формы часто возникали, когда исходное слово адаптировали к русской модели: брали основу и наращивали суффикс -ан- (как в фамилиях Суслов → Сусликов, но здесь другая схема), а потом добавляли -ов. Получается, что Кулипанов могло означать «сын Кулипана», где Кулипан — это уже адаптированная форма какого-то исходного имени.

Самая правдоподобная версия корня — тюркская. В татарском, башкирском и других тюркских языках есть имя Кули (или Кулуй), означающее «раб Божий», «слуга» (от арабского «гулам» через тюркское посредство). Частица -пан может быть искажённым -бан или -ван — распространённый тюркский суффикс принадлежности или уважительного обращения (ср. Ахметжан, где -жан — «душа»). Таким образом, Кулипан — это сложносоставное имя, примерно «раб Божий, господин» или «почтенный слуга». Встречается и вариант Кулибек (бек + кули), где -бек заменяет -пан. Фамилия Кулипанов могла появиться у русских, живших в смешанных регионах (Поволжье, Приуралье), или у крещёных татар, чьё родовое прозвище записали по-русски.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным словом кулипа (или кулипан). В некоторых говорах так называли неловкого, неуклюжего человека, или же это было прозвище от глагола «кулипать» — хромать, ковылять. Однако эта версия слабее: во-первых, слово редкое и не зафиксировано в центральных говорах, во-вторых, фамилия с суффиксом -анов почти всегда указывает на имя, а не на качество. Если бы прозвище было «Кулипа», фамилия звучала бы как Кулипин.

Географически фамилия Кулипанов (и Кулипанова) тяготеет к Уралу и Западной Сибири. В дореволюционных переписях она встречается у крестьян и мещан Пермской, Вятской и Тобольской губерний — как раз в зоне активных контактов с тюркским населением. Сословно предки Кулипановых, скорее всего, были государственными крестьянами или казаками, а не дворянами: фамилия не попала в родословные книги и не имеет аристократических вариантов.

Если коротко: фамилия Кулипанова, вероятнее всего, восходит к тюркскому составному имени Кулипан (почтенный слуга), которое дали предку при крещении или как мирское прозвище в татаро-русской среде. Суффикс -анов указывает на адаптацию через форму на -ан, что типично для фамилий из тюркских основ.