Фамилия Куманикина — редкий пример, где народное прозвище и историческая память могли сойтись в одной основе. Разбираться с её происхождением стоит с двух версий, и первая из них самая прозрачная.

Самое вероятное объяснение лежит на поверхности: прозвище Куманика образовано от слова «куманика». В русских говорах так называли морошку — северную болотную ягоду. Человек мог получить такое прозвище, если промышлял сбором морошки, торговал ею или славился умением делать из неё наливки и настойки. Прозвища по роду занятий или по любимому продукту — одна из самых распространённых моделей в русской ономастике. Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: «чей?» — Куманикин, то есть сын или потомок Куманики.

Вторая версия уводит в глубь веков и связана с этнонимом «куманы». Так в европейских источниках называли половцев — кочевой тюркский народ, который в XII–XIII веках совершал набеги на русские княжества и долгое время соседствовал с южными землями Руси. Память о куманах сохранялась в устной традиции, и прозвище Куманик мог получить человек, который либо происходил из половцев, либо долго жил среди них, либо просто внешне или нравами напоминал кочевника. Эта версия менее вероятна: этнические прозвища в крестьянской среде встречаются, но уступают по частоте бытовым и профессиональным. Однако исключать её полностью нельзя — в южнорусских и украинских землях контакты с половецким населением оставили след и в языке, и в фамилиях.

Фамилия Куманикина — женская форма, а мужская, Куманикин, встречается преимущественно в центральных и южных областях России. По данным современных справочников, фамилия редкая, что говорит о локальном происхождении: скорее всего, прозвище возникло в одной местности и закрепилось за одним родом, не получив широкого распространения. Разобрать её по составу несложно: корень куман-, суффикс -ик (уменьшительный или прозвищный) и фамильный суффикс -ин. Модель образования типична для русских фамилий от прозвищ на -ика: Куманика → Куманикин.

В словаре русских фамилий Б. Унбегауна подобные случаи — прозвища от названий ягод и растений — описаны как характерные для северных и центральных губерний. Если опираться на этот источник, версия с морошкой выглядит предпочтительнее: она не требует дополнительных исторических допущений и хорошо вписывается в бытовую логику прозвищ.