Фамилия Кунат нечасто встречается, и её происхождение открывает сразу несколько путей. Самый вероятный — связь с древнегерманским именем Конрад, которое складывается из двух основ: kuon («храбрый, смелый») и rad («совет»). В русской среде это имя могло трансформироваться в прозвище Кунат, а от него уже образовалась фамилия. Такая модель типична для фамилий, возникших из канонических или западноевропейских имён, которые на славянской почве обретали упрощённую форму.

Однако есть и тюркская версия, которую нельзя сбрасывать со счетов. В тюркских языках корень «күн» означает «солнце», а «куна» — «радость, довольство». Если фамилия действительно имеет тюркские корни, то прозвище Кунат могли дать человеку с солнечным, жизнерадостным нравом. Обе гипотезы имеют право на существование, но первая (германская) выглядит более обоснованной, потому что фамилии, образованные от имени Конрад, встречаются в разных славянских странах (ср. польские Конарски, чешские Конрады), а форма Кунат — один из вариантов адаптации.

С точки зрения словообразования фамилия Кунат — это бессуффиксная модель, то есть она напрямую закрепилась за родоначальником без дополнительных формантов вроде -ов или -ин. Такие фамилии чаще встречались у непривилегированных сословий: крестьян, казаков, мещан. География бытования фамилии сегодня не привязана к какому-то одному региону — носители встречаются и в России, и в странах ближнего зарубежья, что подтверждает смешанные пути её происхождения.