Фамилия Кундаев хранит в себе память о происхождении предка, и её разбор помогает понять, откуда пошёл род. В основе фамилии лежит личное имя Кундай, а сама она образована по стандартной для русских фамилий модели — с помощью патронимического суффикса -ев, который присоединяли к основам, оканчивающимся на -й. Таким образом, Кундаев буквально означает «сын Кундая» или «потомок Кундая».

Само имя Кундай, скорее всего, имеет финно-угорские корни. В языках этой группы встречается корень «кунд-», который означает «край», «местность» или «область». Исходя из этого, именование Кундай могло быть прозвищем для пришлого человека, чужака, которого называли по месту его прежнего жительства — «земляк». Такая модель именования была распространена среди народов Поволжья и Урала, где активно контактировали славянские и финно-угорские племена.

Не исключено, что фамилия могла возникнуть в регионах с сильным финно-угорским субстратом — например, в Вятской, Пермской или Нижегородской губерниях. Там подобные прозвища, указывающие на чужеродность или происхождение человека, были особенно часты. Встречается и вариант написания Кундяев — с буквой «я» после «д», что характерно для некоторых русских говоров, смягчающих твёрдые согласные в личных именах.

В ономастике фамилия Кундаев не относится к числу широко распространённых, что делает её особенно ценной для семейной истории: она сохранила редкую основу, которая может указать на этнические корни предков.