Фамилия Кундера — редкий случай, когда её происхождение почти наверняка связано с одним конкретным языком, но сам корень остаётся загадочным. В отличие от большинства русских фамилий, образованных от крестильных имён или профессий, Кундера, скорее всего, имеет западнославянские корни, а точнее — чешские или словацкие. Об этом говорит и суффикс -а, характерный для чешских фамилий (сравните: Новак, Свобода), и отсутствие типичных русских окончаний -ов, -ин.

Самая распространённая версия возводит основу к чешскому слову «kundera» или «kundřit» — диалектному глаголу, означающему «ворчать», «брюзжать», «бормотать». В этом случае фамилия родилась как прозвище неразговорчивого, вечно недовольного человека или, наоборот, того, кто говорит невнятно, себе под нос. Такая модель типична для славянских языков: прозвище по манере поведения или речи часто закреплялось за родом без изменений.

Вторая, менее популярная гипотеза, выводит фамилию от немецкого «Kunder» — «глашатай», «вестник» (от «künden» — возвещать). Через посредничество чешских земель, где веками жили немецкоязычные общины, это слово могло трансформироваться в Кундера. Однако в чешском языке есть собственное слово «hlásný» или «posel», поэтому заимствование кажется менее вероятным, чем исконное прозвище.

С точки зрения географии, фамилия Кундера — почти исключительно чешская и словацкая. В России она встречается крайне редко и, скорее всего, принадлежит потомкам переселенцев из Австро-Венгрии. В Беларуси и на Украине единичные носители могли появиться через польское посредничество, но здесь фамилия не прижилась массово. Интересно, что в чешском языке ударение в фамилии падает на первый слог — Кундера, а не Кундера, как привыкли русские читатели благодаря писателю Милану Кундере.

Разбор словообразовательной модели прост: это чистая основа без суффикса. Фамилия не склоняется по русским правилам как женская (Кундера пришла), но как мужская — склоняется (Кундеры, Кундере). Отсутствие суффикса — верный признак того, что фамилия застыла в форме прозвища, а не отчества. Никаких сословных ограничений у неё не было: Кундерами могли быть и крестьяне, и горожане, и мелкопоместные дворяне.