Фамилия Кундеров — редкий случай, когда в основе лежит не имя, не профессия и не географическое название, а прозвище, скорее всего, связанное с внешностью или повадками человека. В русских говорах слово «кундер» (или «кундра») имело значение «неуклюжий, неповоротливый человек», «увалень». В некоторых диалектах так называли и того, кто ходит вразвалку, переваливаясь. Таким образом, первый носитель фамилии мог получить прозвище Кундер за медлительность или грузную фигуру.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ов присоединяется к основе прозвища, указывая на принадлежность («чей?» — сын Кундера). Это патронимическая модель, но не от крестильного имени, а от бытового прозвища. Важно отличать Кундерова от похожих фамилий, образованных от немецкой фамилии Кундерт (Kundert) или от тюркского корня «кун» (солнце, день) — в случае с Кундеровым такая связь маловероятна, так как суффикс -ер не характерен для тюркских прозвищ.

Географически фамилия встречается в основном в центральных и южных регионах России, но без ярко выраженного гнезда. Встречается также в украинском варианте Кундеренко. Социальный контекст: в дореволюционной России Кундеровы, скорее всего, были крестьянами или мещанами, так как прозвища такого типа редко встречались в дворянской среде. Фамилия не имеет отношения к титулам или сословной аристократии — это чисто бытовое, «уличное» именование, которое закрепилось за родом.