Фамилия Кундро — редкий пример фамилии, застывшей в форме чистой основы, без типичных славянских суффиксов -ов, -ин или -ский. Такие «голые» фамилии (как Шевченко, Гаврилюк или Тимошенко) характерны в первую очередь для украинской ономастики, где суффикс -о часто выполнял функцию прозвищного или патронимического окончания. Поэтому Кундро с высокой вероятностью имеет украинские или южнорусские корни.

Основа фамилии — «кундр» — неоднозначна. Самая правдоподобная версия связывает её с диалектным словом «кундра», которое в говорах юго-западных областей означало «неряха», «растрёпа», «неопрятный человек». Прозвище Кундра могли дать человеку с небрежной внешностью или беспорядочным хозяйством. В таком случае фамилия Кундро — это архаичное украинское прозвище, перешедшее в наследственное именование без дополнительного оформления.

Менее распространённая, но допустимая версия — связь с личным именем Кундрат (производное от Кондрат, Кондратий). В белорусских и украинских говорах имя Кондрат нередко сокращали до Кундра или Кундро. Тогда фамилия — это усечённый патроним: «сын Кундры» или просто «Кундро» как домашнее имя.

Встречается фамилия Кундро и в польской ономастике, где -о — типичное окончание прозвищ (ср. Яро, Дзяло). Польское слово «kundel» означает «дворняга», но прямой связи с «кундр» нет — скорее, это случайное звуковое совпадение.

С точки зрения географии, носители фамилии Кундро рассеяны: единичные записи встречаются в Украине (особенно на западе), в Беларуси и в южных областях России. Фамилия никогда не была массовой, что подтверждает её происхождение от редкого прозвища или местного имени.

Таким образом, предок человека с фамилией Кундро — скорее всего, выходец из украинских или белорусских земель, получивший прозвище за неопрятность (если верить диалектной версии) или носивший краткую форму имени Кондрат. Обе версии вписываются в славянскую модель образования фамилий от прозвищ, но первая — диалектная — выглядит более аргументированной благодаря живой лексической параллели.