Фамилия Куняхов — довольно редкая и неоднозначная с точки зрения происхождения. Её основа — «Кунях» — не встречается в современных источниках как самостоятельное имя или прозвище, поэтому этимологам приходится строить гипотезы, опираясь на фонетику и диалекты.

Самый вероятный путь — связь с тюркским корнем «кун» (солнце, день) или «куня» (младший, меньшой). В тюркских языках «куняк» могло означать «солнечный», «светлый» или же «младший сын». Если это так, то прозвище Кунях дали человеку за внешность (например, светловолосому) или за положение в семье. Суффикс «-ов» стандартно указывает на принадлежность: «сын Куняха».

Вторая версия — русская диалектная. В северных и сибирских говорах словом «куня» иногда называли куницу или мех куницы. Прозвище Кунях мог получить ловкий, юркий охотник или, наоборот, человек, торговавший пушниной. Однако эта версия менее убедительна: обычно прозвища от названий зверей образовывались напрямую (Куница, Кунин), а форма «Кунях» скорее указывает на иноязычное влияние.

Интересно, что фамилия Куняхов практически не встречается в центральных областях России, но фиксируется в Поволжье и на Урале — регионах с давними тюркскими контактами. Это косвенно подтверждает первую, тюркскую, гипотезу. Фамилия могла возникнуть в среде татар, башкир или чувашей, а затем обрусела через добавление типичного русского суффикса.

Словообразовательная модель проста: основа «Кунях» + патронимический суффикс «-ов». Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Куня́хов. В дореволюционных документах фамилия могла писаться через «о» — Куняховъ, что не меняет её смысла.

Таким образом, предок современного Куняхова — человек по прозвищу Кунях. Скорее всего, он жил на стыке культур, в зоне контакта славянских и тюркских народов, и получил имя за цвет волос или за то, что был младшим в семье.