Фамилия Кунякина — женская форма от Кунякин, и её происхождение связано с прозвищем или именем Куняка. Основа здесь неочевидна на первый взгляд, но разбор показывает, что корень «кун» имеет несколько возможных значений, и каждое ведёт в свою сторону.

Самый прямой путь — от слова «куня» (или «кунька»). В русских говорах так называли куницу, а также мех этого зверька. Прозвище Куня могли дать человеку за ловкость, хитрость или за то, что он промышлял пушниной. Суффикс -ак в фамилиях часто указывал на признак по действию или свойству: Куняк — тот, кто связан с куницей, кто на неё похож повадками. Тогда Кунякин — сын Куняка, то есть потомок человека с таким прозвищем.

Есть и другая версия, менее распространённая, но лингвистически возможная. В древнерусском языке «куна» — денежная единица, название пошло от того же куницего меха, который использовали как средство расчёта. Кунякой могли прозвать менялу, торговца или человека, прижимистого в деньгах. Однако эта гипотеза уступает первой: прозвища от названий животных встречаются в русской ономастике гораздо чаще, чем от названий монет.

Суффикс -ин в окончании фамилии (Кунякин) — классический русский патроним: «чей?» — Кунякин, то есть принадлежащий Куняке. Такая модель характерна для фамилий, образованных от имён и прозвищ на -а, -я. Географически фамилия Кунякина встречается в основном в центральных и южных регионах России, но редкая — её носителей немного, и она не входит в число массовых.

Социальный контекст прост: Кунякины, скорее всего, происходят из крестьянской или мещанской среды, где прозвища давали по внешним признакам или занятиям. Дворянских корней у фамилии не зафиксировано. Если искать однокоренные фамилии, то это Куницын, Кунеев, Куняев — все они восходят к тому же звериному корню, но с разными суффиксами. Кунякин среди них выделяется именно редким окончанием -як, которое придаёт прозвищу оттенок уменьшительности или принадлежности к чему-то конкретному.