Фамилия Купчинецкая — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не ремесло, а, скорее всего, географическое прозвище, осложнённое социальным оттенком. Несмотря на прозрачный корень «купч-», который сразу вызывает ассоциации с купцами, напрямую к этому сословию фамилия не отсылает.

Разберём словообразовательную цепочку. Суффикс -ец в русских фамилиях часто указывает на принадлежность к местности: житель такого-то места. Например, Ростовец (из Ростова), Торопец (из Торопца). От этого названия жителя с помощью типичного для западных и юго-западных земель суффикса -ин (в женском роде -ская) образована фамилия. То есть «Купчинец» — это человек, который родом из некоего места, называвшегося Купчино или Купчин. Исходная точка — прозвище «Купчинец», означавшее «выходец из Купчина».

Самая вероятная географическая привязка — деревня или урочище с названием Купчино. Такие топонимы известны в Беларуси (например, в Витебской области) и на западе России. Название селения, в свою очередь, могло произойти от фамилии или прозвища первого поселенца, связанного с торговлей: «Купча» или «Купчик». В старину «купчей» называли не только купца, но и вообще человека, занимающегося куплей-продажей, возможно, даже перекупщика.

Таким образом, фамилия Купчинецкая — это «бывшая жительница Купчина» (или дочь такого жителя). В мужском варианте фамилия звучала бы как Купчинецкий. Такая модель характерна для польско-белорусского и украинского ареала, где фамилии на -ский/-цкий часто были дворянскими или шляхетскими, но в данном случае, скорее всего, просто указывали на место рождения. Прямой связи с богатым купечеством нет: предки носительницы фамилии были, вероятно, крестьянами или мещанами, переселившимися из деревни Купчино, название которой лишь отдалённо связано с торговлей.