Фамилия Купрялис — почти стопроцентный маркер литовского или, шире, балтийского происхождения. Окончание -ис (в оригинале -is) — характернейший признак литовских фамилий мужского рода, где оно играет ту же роль, что русское -ов или польское -ский. Поэтому искать корни фамилии в русском языке напрямую не стоит: перед нами не адаптированная форма, а исходная литовская.

Основа Купря- почти наверняка восходит к литовскому личному имени Купряс (Kuprys) или к прозвищу, произведённому от kupra — «горб», «горбатый». В литовской антропонимике прозвища по физическим особенностям давали часто и охотно, и Kuprys означало бы «горбун» или «сутулый». Соответственно, Купрялис — это отчество, образованное по продуктивной модели: Kuprys → Kuprelis (сын Купряса). Устойчивый суффикс -el- в литовском языке уменьшительно-патронимический, так что буквально фамилию можно перевести как «маленький Купряс» или «Купрясович».

Интересно, что в русском языке существует фамилия Куприянов, идущая от крестильного имени Киприан (Куприян). Внешнее сходство Купрялиса и Куприянова обманчиво. Купрялис не имеет отношения к христианскому имени Киприан — это чисто балтийская, дохристианская по корню фамилия. Смешение возможно только в случае, если литовец по фамилии Купрялис жил в русскоязычной среде, и его фамилию записывали на слух как Купрянов или Купреев, но такие случаи единичны.

Географически фамилия тяготеет к северо-востоку Литвы и исторической Жемайтии. Встречается она и в современной Литве, и среди литовской диаспоры. В России и Беларуси Купрялисы — это, скорее всего, потомки литовцев, переселившихся в XIX–XX веках, или результат литуанизации фамилии при записи в метрические книги (литовские окончания могли сохранить, если священник или писарь знал язык).

Социальный контекст прост: фамилия не дворянская, не шляхетская. Подавляющее большинство носителей — крестьянского или мещанского происхождения. В списках литовской знати и в «Гербовнике» такой фамилии нет.