Фамилия Купрюнина, как и многие русские фамилии, начинается с разбора мужской основы — Купрюнин. Она образована от имени Купрюн, которое, в свою очередь, является просторечной, «домашней» формой крестильного имени Киприян (в более привычном звучании — Куприян). Греческое имя Киприанос буквально означает «житель Кипра», и на Руси оно было известно благодаря святому мученику Киприану Карфагенскому, почитаемому в православии.

Модель образования здесь классическая: суффикс -ин указывает на принадлежность. Купрюнин — это «сын Купрюна» или «человек из рода Купрюна». Такая модель (основа на -а/-я плюс -ин) типична для северных и центральных областей России, где фамилии часто закреплялись именно в такой форме, в отличие от южных, где преобладает -ов/-ев.

Интересно, что имя Купрюн — не единственный вариант народной переработки церковного Киприан. В разных говорах бытовали формы Купря, Куприк, Куприян, Купрей. Фамилия Купрюнина — одна из самых редких в этом ряду, что делает её ценной для локальной истории. В документах начала XX века встречаются конкретные носители: Купрюнин Александр Кузьмич (1897 года рождения) и Купрюнин Андрей Лаврович (1886 года рождения, уроженец села Городище Тульской области). Эта привязка к Тульской губернии не случайна: именно в центрально-чернозёмных регионах, где были сильны традиции акающего говора (произношение «Купр» вместо «Кипр»), такие фамилии и закрепились чаще всего.

По сути, фамилия Купрюнина — это бытовой маркер: предок носителя, скорее всего, был крестьянином или мещанином из центральной России, которого в обиходе звали не полным церковным именем, а его сокращённым, «уличным» вариантом Купрюн.