Фамилия Курданина — женская форма, а её мужской вариант — Курданин. В русской традиции фамилии на -ин обычно образовывались от основ, оканчивающихся на -а или -я. Здесь основа «Курдан», и суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — «Курданин», то есть сын или потомок человека по прозвищу или имени Курдан.

Что стоит за основой «Курдан»? Самая вероятная версия — тюркское происхождение. В тюркских языках «курдан» (или близкие формы) может означать «установленный», «утверждённый», а иногда — «жертвенный» или «посвящённый». Встречается и значение «брат по клятве», «побратим» (от тюркского «курдаш»). В русских говорах слово не зафиксировано, поэтому прозвище Курдан могли дать человеку, имевшему тесные связи с тюркоязычными соседями, либо выходцу из татарской или башкирской среды, который обрусел.

Менее распространённая, но возможная версия — связь с диалектным глаголом «курдать» (в некоторых говорах — «шалить, проказничать»). Однако эта гипотеза слабая, так как глагол редкий и не образует устойчивых прозвищ.

Географически фамилия Курданин (и Курданина) встречается в основном в Поволжье и на Урале — в регионах, где исторически был плотный контакт русского и тюркского населения. Встречается она нечасто, что говорит о локальном происхождении.

Таким образом, предки носителей фамилии Курданина — скорее всего, русские крестьяне или мещане, получившие прозвище от тюркского слова, либо обрусевшие татары или башкиры. Фамилия недворянская, типичная для крестьянской среды, где прозвища часто давались по внешним или социальным признакам.