Фамилия Курманходжаев — яркий пример того, как в одной фамилии соединились два пласта: тюркский религиозный термин и арабское звание. Она образована от сложного мужского имени Курманходжа, которое состоит из двух корней. Первый — «курман» (в тюркских языках — «жертва», «жертвоприношение»), второй — «ходжа» (от персидского «хваджа» — «господин», «хозяин», а в исламской традиции — почётное звание потомка пророка или просто учителя, наставника). Вместе имя Курманходжа можно перевести как «жертва (во имя) ходжи» или «жертвующий собой ради наставника», что указывало на глубокую религиозность или принадлежность к суфийским братствам.

Фамилия Курманходжаев образована по русской патронимической модели с суффиксом -ев, который присоединяется к основам на мягкий согласный или -а/-я. Буквально она означает «сын (или потомок) Курманходжи». Такая модель типична для фамилий, возникших у тюркских народов в XIX–XX веках, когда после вхождения в состав Российской империи начала оформляться фиксация родовых имён по русскому образцу.

Географически фамилия Курманходжаев распространена прежде всего среди узбеков, таджиков и других народов Средней Азии. Встречается она и в Казахстане, но реже, так как в казахской ономастике более типична форма Курманкожа (с другим написанием). Поскольку имя Курманходжа было распространено у духовных лиц и зажиточных горожан, носители фамилии в прошлом могли происходить из среды исламских учёных, мулл или купцов, связанных с караванной торговлей. В советское время фамилия утратила сословную окраску и стала просто наследственным именем.

Интересно, что в некоторых регионах, особенно в Ферганской долине, встречается вариант написания с одной «н» — Курмаходжаев. Это не ошибка, а отражение местного произношения, где звук «н» в потоке речи редуцируется. Однако в официальных документах чаще закреплён полный вариант — с двумя согласными, что подчёркивает исходную форму имени.