Фамилия Кусабаева — тюркская по происхождению, скорее всего казахская. Она образована по типичной для тюркских языков модели: к личному имени или прозвищу добавляется компонент -бай, что значит «богатый», «хозяин», «господин». В дореволюционной кочевой среде это был знак достатка и уважения, а имена с -бай давали с пожеланием благополучия.

Основа «Куса» в первой части — не очевидна на первый взгляд. Скорее всего, это не имя напрямую, а искажённое или диалектное произношение арабского имени Хусаин (Хусейн) — «красивый», «хороший». В казахском языке звук «х» часто выпадает или заменяется на «к», и Хусаин превращается в Кусаин. Отсюда Кусабай — «богатый, как Хусаин» или «богатство Хусаина». Менее вероятно, что «куса» связана с тюркским глаголом «кусу» (рвать, тошнить) — такое прозвище вряд ли стало бы основой для имени с пожеланием богатства.

Женский вариант фамилии Кусабаева — это форма, указывающая на принадлежность роду Кусабаевых. В казахской традиции фамилии закрепились поздно, в советское время, и их часто давали по отцу или деду. Предок носительницы этой фамилии, вероятно, был Кусабай — человек, пользовавшийся авторитетом, возможно, старшина рода или зажиточный скотовод.

Географически фамилия встречается в Казахстане, особенно в южных и западных областях (Кызылординская, Актюбинская, Мангистауская), а также среди казахов в России. В русском языке фамилия пишется через «е» в окончании, что стандартно для передачи казахских фамилий женского рода. Единичные случаи бытования у других тюркских народов (например, у башкир или татар) возможны, но маловероятны — модель на -баев/-баева наиболее характерна именно для казахской ономастики.