Фамилия Кускунова — женская форма фамилии Кускунов, которая встречается нечасто и имеет заметный тюркский след. Её основа — прозвище или имя Кускун, которое восходит к тюркскому глаголу со значением «спасаться», «убегать», «избегать». В некоторых тюркских языках, например в башкирском и татарском, слово «кускун» может означать «беглец», «тот, кто спасся» или даже давалось как имя-оберег: считалось, что такое имя отведёт от ребёнка беды и болезни. Встречается и другая версия — от тюркского «кус» (птица) с уменьшительным суффиксом, то есть «птичка», но она менее убедительна, так как модель «кус-кун» скорее указывает на действие, а не на птицу.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Кускун добавили патронимический суффикс -ов, а затем для женского варианта — окончание -а. Такая схема типична для фамилий, которые закрепились в XVI–XIX веках у народов Поволжья и Приуралья, особенно среди башкир, татар и мишарей, переходивших на русскую фамильную систему. Географически фамилия Кускуновы чаще всего встречается в Оренбургской, Челябинской областях и Башкортостане — именно в тех регионах, где тюркские имена органично вписывались в русскую документацию.

Интересная деталь: фамилия могла сохраниться в написании через «о» (Кускунов), а не через «а» (Каскунов), что указывает на оглушение гласной в безударном положении. В старых метрических книгах XIX века встречаются варианты «Кусконов» и даже «Кускинов», что говорит о неустойчивости записи на слух. Среди однокоренных фамилий — Кусков, Кускин, Кусканбаев, но Кускунов стоит особняком именно благодаря редкому суффиксу -ун, который в тюркских именах часто обозначает результат действия или состояния.

Прямых указаний на сословную принадлежность Кускуновых нет: это могли быть как государственные крестьяне, так и казаки, и даже мелкие служилые люди. Фамилия не дворянская и не купеческая — она бытовая, прозвищная, что типично для основной массы русских и тюркоязычных фамилий Урала и Заволжья.