Фамилия Кусто — редкий для России случай, когда она не «русская» по происхождению, но звучит абсолютно органично в русском языке. Вопреки интуиции, её не стоит связывать с известным мореплавателем Жак-Ивом Кусто: это французская фамилия, означающая «портной» (от старофранцузского costurier). Однако в русском контексте у неё совсем другая история.

На русской почве фамилия Кусто почти наверняка имеет прозвищное происхождение. Основа — диалектное слово «куст» или «кусто» (кустарник, заросли). В северных и сибирских говорах «кустой» называли густой, непроходимый лес, а «кусто» — самого человека, живущего в такой глуши или, наоборот, скрытного, «заросшего» в себе. Фамилия могла закрепиться за жителем лесной деревни, охотником или человеком с нелюдимым нравом.

Модель образования здесь — суффикс -о, который в русской ономастике встречается реже, чем -ов или -ин. Обычно это краткая форма от прозвища или имени (как у фамилий Черно, Худо, Добро). Кусто — это «сын Куста» или «человек из рода Куста». Такие фамилии характерны для западнорусских и украинских земель, где усечённые формы на -о сохранялись дольше, а также для казачьей среды (Дон, Кубань).

В словаре Веселовского («Ономастикон») есть упоминание прозвища Куст — не фамилии, а именно личного имени-прозвища, которое бытовало в XV–XVI веках. Это подтверждает, что основа была живой и самостоятельной. Фамилия Кусто могла возникнуть как отчество от этого прозвища без дополнительных суффиксов — по той же модели, что и фамилии типа Шило, Перо, Крыло.

Если ваши предки носили фамилию Кусто, ищите их корни не во Франции, а в глухих лесах русского Севера или в подмосковных деревнях, где «кустом» называли не только растение, но и человека, который «из-за куста глядит». Сословная принадлежность, скорее всего, крестьянская или мещанская — в дворянских родословных эта фамилия не фиксируется.