Фамилия Кустомарова — женская форма фамилии Кустомаров. Её основа неочевидна и даёт простор для лингвистической разминки. В отличие от фамилий, образованных от очевидных профессий (Кузнецов, Плотников) или имён (Иванов, Петров), Кустомаров требует заглянуть в словари и старые говоры.

Словообразовательная модель здесь классическая: суффикс -ов- указывает на принадлежность («чей?» — Кустомарова — дочь или жена Кустомарова). Сам же корень «кустомар» — это прозвище или мирское имя. Самый прямой вариант: от слова «куст» и глагола «марать» (пачкать). Прозвище Кустомара могли дать человеку, который пачкался, работая в кустах, — например, сборщику ягод или леснику, который вечно ходил в грязи и соке растений. В русских говорах слово «марать» имело и переносное значение — «делать кое-как, халтурить». Тогда Кустомара — неаккуратный работник, который «марает кусты», то есть плохо ухаживает за посадками.

Есть и более редкая, но правдоподобная версия, связанная с диалектным словом «кустомара». В некоторых регионах так называли заросли кустарника, которые постоянно мешали пахоте или косьбе. В этом случае прозвище Кустомара получил человек, живший у таких зарослей или владевший участком, заросшим кустами.

По сословному составу носители фамилии Кустомаровы, скорее всего, относились к крестьянам или однодворцам. Фамилия не дворянская и не купеческая — она слишком привязана к сельскому быту и труду. Географически фамилия встречается в центральных и южных областях России, особенно в Курской и Орловской губерниях, где были сильны диалекты с такими словами.

Сравните с однокоренными фамилиями: Кустов (от «куст»), Маров (от прозвища «Мара» — пачкун), Кустомаров — самая сложная и конкретная, с двойным корнем, что делает её редкой и ценной для историка языка.