Фамилия Кустурова хранит в основе нечто, что сразу бросается в глаза: корень «куст». На первый взгляд кажется, что она произошла от прозвища человека, жившего у кустов или занимавшегося кустарником. Но это лишь один из слоёв. Притяжательный суффикс «-ов» указывает на принадлежность: Кустуров — чей? — сын Кустура. Значит, исходным было личное прозвище Кустур. А вот тут начинается самое интересное.

В русских говорах слово «кустур» не зафиксировано как общеупотребительное. Однако есть версия, что это диалектная или искажённая форма слова «куст» с суффиксом «-ур», который встречается в прозвищах, обозначающих что-то корявое, густое или низкорослое (сравните: «чубук», «басур»). В таком случае Кустур — прозвище человека приземистого, плотного или, наоборот, нелюдимого, «заросшего», как куст. Более прозаичная гипотеза связывает фамилию с профессией: кустарём в некоторых местах называли не только ремесленника, но и того, кто живёт «кустом» — отдельным хутором, в стороне от села. Тогда Кустуров — потомок хуторянина, отшельника или человека, который «осел кустом» на новом месте.

Примечательно, что фамилия Кустуров (и женская форма Кустурова) довольно редкая. Она не встречается массово в центральных губерниях, а тяготеет к южнорусским и поволжским областям, где слово «куст» в значении «отдельное поселение» или «группа дворов» было в ходу. В ономастических словарях (например, у Б. Унбегауна) подобные образования от названий растений и ландшафта традиционно относят к «географическим» прозвищам. Таким образом, предок современного носителя фамилии Кустурова с высокой долей вероятности был либо человеком, получившим прозвище за внешность или характер (коренастый, нелюдимый), либо жителем отдалённого хутора, что в условиях общинной России было заметной социальной чертой.

Интересно и то, что фамилия не имеет уменьшительной или уничижительной окраски (нет суффиксов «-к-», «-ищ-»). Она звучит скорее как уважительное или нейтральное прозвание по месту жительства. Встречаются однокоренные варианты — Кустарёв, Кустиков, но Кустуров стоит особняком из-за редкого суффикса «-ур», который делает её более архаичной и загадочной.