Фамилия Кутенцин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её разбор стоит начать с окончания: -ин указывает на притяжательную модель «чей?» — сын или потомок человека, которого звали Кутенца или Кутенец. Основа здесь нестандартная: если бы фамилия звучала как Кутенцев, она бы легко легла в ряд отчеств от прозвища Кутенец. Но суффикс -цин встречается реже и, скорее всего, возник в результате диалектного или фонетического изменения: в ряде русских говоров окончания -ев и -ин могли смешиваться, особенно если исходное имя или прозвище заканчивалось на мягкий согласный или -ц. То есть Кутенцин — это вариант фамилии Кутенцев, где конечное -ц перешло в -ц- под влиянием местного произношения.

Само прозвище Кутенец, от которого всё пошло, имеет несколько версий. Самая вероятная связана с глаголом «кутать» — укутывать, заворачивать. В старину так могли назвать человека, который любил тепло одеваться, или же того, кто занимался изготовлением тёплой одежды, кутался в тулуп. В северных и центральных губерниях России слово «кута» означало также плохую, ненастную погоду — отсюда прозвище могло закрепиться за человеком угрюмым или родившимся в непогоду. Менее вероятна связь с тюркскими корнями (например, «кут» — счастье, благодать), так как суффикс -енец типичен для русской ономастики, а не для заимствований.

Географически фамилия Кутенцин зафиксирована в единичных случаях, в основном в центральных и южных регионах России. В дореволюционных метрических книгах она встречается в Курской и Воронежской губерниях, что подтверждает её южнорусское происхождение. Сословная принадлежность не прослеживается однозначно: носители могли быть как крестьянами, так и мещанами, но отсутствие дворянских родов с такой фамилией говорит о её простонародном корне. Фамилия не получила широкого распространения и осталась локальной, что делает её особенно интересной для тех, кто ищет свои корни в конкретной местности.