Фамилия Лабудкин — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка связано с характером или манерой поведения, а не с профессией или внешностью. В центре — слово «лабуда», которое в русских говорах означало чепуху, вздор, ерунду, пустую болтовню или бессмысленное занятие. Соответственно, Лабудкой в народе могли прозвать болтуна, пустомелю, человека, который говорит много, но без толку, или же того, кто занимается несерьёзным, вздорным делом. Суффикс -к- в основе типичен для русских прозвищ, а фамильный суффикс -ин указывает на принадлежность: «сын Лабудки».

Модель образования проста и прозрачна: прозвище Лабудка → Лабудкин. Такие фамилии на -ин в русской традиции массово возникали в XV–XVII веках, особенно в среде крестьянства и посадских людей. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — это фамилия простонародная, что подтверждается и её смысловой окраской: прозвище с оттенком насмешки или лёгкого презрения вряд ли дали бы человеку высокого социального статуса.

Любопытно, что у фамилии есть «двойник» — Лабуткин. Оба варианта восходят к одному корню, но различаются суффиксом: -ут- вместо -уд-. В ономастике такая вариативность встречается нередко и объясняется диалектными особенностями произношения: в некоторых говорах «д» и «т» на конце основы могли смешиваться. Обе формы — Лабудкин и Лабуткин — фиксируются в основном в центральных и южнорусских регионах, но ни одна из них не входит в число распространённых.

Фамилия Лабудкин не упоминается в классических работах по русской ономастике — ни у Унбегауна, ни у Никонова, ни у Веселовского. Это дополнительно указывает на её локальный, неширокий характер. Скорее всего, она бытовала в какой-то одной местности или даже в одном селе, где прозвище Лабудка было понятно всем, а за его пределами теряло смысл. Сегодня носители фамилии встречаются редко, но она сохраняет живую связь с народной речью и метким словом, которым когда-то наградили предка.