Основой фамилии Лабунько послужило мирское имя Лабунь. Скорее всего, некрестильное имя Лабунь происходит от восточнославянского глагола «лабуніць», что в переводе на русский язык означает «ласкать». Вероятно, так называли любимого ребенка, баловня. Согласно другой версии, в основе фамилии Лабунько лежит не имя, а прозвище Лабунь, которым прозвали внимательного, заботливого, ласкового родителя. Однако нередко Лабунем называли того, кто пытался во всем угодить человеку, стараясь расположить его к себе. В этом случае прозвище указывает на особенности характера родоначальника Лабунько. Существует гипотеза, по которой прозвище Лабунь восходит к топониму Лабунь. Лабунь – это название села, расположенного в Заславском районе Волынской области (Украина). Таким образом, предок Лабунько мог быть выходцем из этого населенного пункта.