Фамилия Лабышева — женская форма мужской фамилии Лабышев, и её происхождение напрямую связано с прозвищем или мирским именем родоначальника. В основе лежит слово «лабыш» — так в русских говорах называли небольшой хлеб, каравай или лепёшку. Слово это, в свою очередь, восходит к диалектному глаголу «лабызать» (есть, жевать), который фиксируется в северных и сибирских говорах. Таким образом, первый носитель фамилии мог получить прозвище Лабыш по роду занятий (пекарь, хлеботорговец) или по внешней особенности — например, за любовь к еде или за округлые, мягкие черты лица, напоминавшие каравай.

Модель образования фамилии стандартна для русского ономастикона: к основе на -ш добавился притяжательный суффикс -ев (в мужском роде Лабышев, в женском — Лабышева). Форма на -ев, а не на -ов, объясняется тем, что основа оканчивается на мягкий шипящий («ш» в древности был мягким). Это типичная модель для фамилий, возникших в среде крестьян и посадских людей в XVI–XVII веках, когда прозвища на -ыш, -уш были особенно распространены.

С географической точки зрения фамилия Лабышев/Лабышева тяготеет к Русскому Северу и Поволжью. В переписных книгах XVII века встречаются крестьяне с прозвищем Лабыш в Вятской и Пермской губерниях. В современных телефонных справочниках и базах данных носители фамилии чаще всего фиксируются в Кировской, Нижегородской областях и в Удмуртии. Это косвенно подтверждает, что фамилия сформировалась именно в севернорусском диалектном ареале, где слово «лабыш» было в ходу.

Стоит упомянуть и менее вероятную, но возможную версию: в некоторых тюркских языках есть корень «лабы» со значением «глина» или «ил». Если предположить, что фамилия возникла в зоне русско-тюркского пограничья, исходным могло быть прозвище Лабыш — «глинистый», «живущий у глинистого берега». Однако эта гипотеза слабее, поскольку суффикс -ыш для тюркских заимствований в русской антропонимии нетипичен, а документальных подтверждений такой этимологии нет. Основная версия — хлебная, народная и диалектная — остаётся наиболее убедительной.