Фамилия Ладоненко образована от прозвища Ладонь, которое восходит к существительному «ладонь». Вероятно, так называли человека с красивыми, аккуратными ладонями. В этом случае прозвище Ладонь может относиться к так называемым «профессиональным» именованиям, указывающим на род деятельности человека. Исходя из этого, можно предположить, что основатель рода Ладоненко занимался обмолотом хлеба или был земледельцем.

Однако здесь стоит обратить внимание на суффикс. -енко — типичный для украинских и южнорусских фамилий патронимический суффикс, означающий «маленький» или «потомок». Ладоненко — это буквально «сын Ладоня» или «потомок Ладони». Географически фамилия тяготеет к левобережной Украине и землям бывшей Гетманщины, где суффикс -енко был основным способом образования фамилий.

Прозвище Ладонь закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Ладоненко. Есть и альтернативная, более редкая версия: в древнерусских говорах «ладонь» могло означать не только часть руки, но и «лад», «согласие», «мир». В таком случае прозвище могли дать миролюбивому, покладистому человеку, с которым легко найти общий язык. Эта версия менее популярна, но имеет право на существование, особенно если учесть, что корень «лад» широко распространён в славянской антропонимии.

Главное, что объединяет обе версии: фамилия Ладоненко не имеет отношения к географическим названиям или церковным именам. Её основа — яркое, бытовое прозвище, которое дали по внешнему признаку или по характеру.