Фамилия Лагуточкин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Её основа — уменьшительно-ласкательная форма Лагуточка, которая восходит к церковному имени Лонгин (или Логгин). Само имя Лонгин происходит от латинского longinus, что означает «длинный». В христианском предании это имя носил римский воин, пронзивший копьем бок распятого Иисуса Христа. Таким образом, потомок человека по имени Лагуточка со временем получил фамилию Лагуточкин.

В этой фамилии стоит обратить внимание на редкий суффикс -очк-, который в русских фамилиях встречается нечасто. Обычно уменьшительные формы имён образуются с суффиксами -к- (Лагутка) или -ушк- (Лагушка). Форма Лагуточка — более ласковая и, возможно, региональная. Это указывает на то, что фамилия могла возникнуть в среде, где была распространена особая традиция образования прозвищ и имён. О точном месте и времени появления фамилии Лагуточкин говорить сложно, так как процесс формирования фамилий был длительным и не всегда зафиксирован в документах. Тем не менее, эта фамилия — живой след народной словесности и культуры, сохранивший редкую словообразовательную модель.