Фамилия Лапис — редкий случай, когда прозвище перешло в наследственное имя почти без изменений, без типичных русских суффиксов -ов, -ев или -ин. В русской традиции фамилии на -ис, -ус, -ас часто указывают на польское, белорусское или украинское происхождение, где суффикс -ис мог выполнять роль уменьшительности или принадлежности. Но с основой «лап-» всё сложнее.

Самая прямая версия — прозвище от слова «лапа». В старину «лапой» называли не только ступню зверя, но и руку человека — грубую, большую, неуклюжую. Человек с такими руками или тяжёлой походкой легко получал прозвище Лапа, а его сын или внук уже записывался как Лапис. В украинских говорах «лапа» означала ещё и ветку, сук, что могло относиться к человеку долговязому или неуклюжему.

Вторая, менее очевидная версия — от названия камня лазурита. В старину его называли «лапис-лазурь», но это слово пришло из латыни через немецкий и в быту крестьян почти не встречалось. Скорее всего, если фамилия и связана с камнем, то носитель был не добытчиком, а торговцем или ремесленником, работавшим с поделочными камнями, — например, резчиком печатей. Однако это более поздняя городская версия, а фамилия Лапис встречается и в крестьянской среде.

В польском языке есть слово «łapa» (лапа), и фамилия Łapis могла возникнуть как прозвище от него же, но с польским суффиксом -is. После разделов Речи Посполитой многие носители такой фамилии оказались на территории Российской империи, и написание русифицировалось в Лапис.

Интересно, что фамилия Лапис почти не имеет однокоренных «собратьев» вроде Лапкин или Лапунов, которые распространены шире. Это говорит о том, что она возникла в узкой локальной среде — вероятно, в западных губерниях, где смешивались русские, белорусские и польские модели имяобразования. Носителей Лапис немного, и они в основном сосредоточены на юго-западе России, в Беларуси и на востоке Украины.

Сословной привязки у фамилии нет: Лаписы могли быть и крестьянами, и мещанами, и духовенством. В метрических книгах XIX века эта фамилия встречается у псаломщиков и дьячков, что неудивительно — в церковной среде часто использовали нестандартные прозвищные фамилии без суффиксов.