Фамилия Лашкари — редкая для России, и её происхождение напрямую связано с Востоком. В основе лежит тюркское или персидское слово «лашкар» (lâşkar), что означает «войско», «армия», «военный отряд». Соответственно, прозвище Лашкари давали либо воину, либо человеку, имевшему отношение к военному делу — например, служивому или сборщику ополчения. В тюркских языках (особенно в азербайджанском и турецком) слово «лешкер» также обозначает солдата, поэтому фамилия могла закрепиться за потомками профессиональных военных.

Словообразовательная модель здесь нетипична для исконно русских фамилий. Суффикс -и, а не привычные -ов или -ин, указывает на то, что фамилия, скорее всего, пришла из регионов с сильным тюркским или иранским влиянием — из Закавказья, Средней Азии или Поволжья. В русской традиции такая форма могла сохраниться без изменений, если носитель переселился в центральную Россию, или же фамилию могли русифицировать, превратив в Лашкарев или Лашкаров, но исходный вариант Лашкари остался в документах.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с топонимом Лашкар (или Лашкаргах) — историческим городом в Афганистане. В таком случае Лашкари — это указание на выходца из этого места, то есть «лашкари» в значении «житель Лашкара». Однако, учитывая распространённость военной лексики в тюркских именованиях, версия с прозвищем-профессией выглядит убедительнее.

Встречается фамилия и у народов Северного Кавказа — например, у лезгин, где слово «лашкар» тоже означает «войско». Таким образом, предки человека с фамилией Лашкари могли быть либо солдатами в широком смысле, либо людьми, жившими вблизи древних военных трактов и крепостей.