Фамилия Латын — редкий случай, когда географический корень почти очевиден, но не даёт однозначного ответа. Скорее всего, в её основе лежит прозвище, данное человеку, имевшему отношение к латинскому языку или католическому Западу. В старину «латынью» на Руси называли не только древний язык учёных, но и всё латинское вероисповедание — католицизм. Поэтому носитель прозвища Латын мог быть либо грамотеем, знающим латынь (например, дьячок или подьячий, обучавшийся в школе), либо человеком, побывавшим в католических странах или имевшим с ними дела.

Словообразовательная модель фамилии — бессуффиксная, что характерно для прозвищ, перешедших в фамилии без изменений (ср. Голова, Сорока, Ум). В русской традиции фамилии на -ин, -ов куда распространённее, а Латын осталась в форме чистого прозвища. Это говорит о том, что фамилия могла закрепиться в среде, где фамилии ещё не были окончательно оформлены, или на окраинах государства, где влияние канцелярской нормы было слабее. Встречается она преимущественно в южнорусских и украинских регионах, где контакты с католическим миром были теснее, а также в казачьей среде.

Есть и другая, менее вероятная версия: фамилия могла произойти от тюркского имени или прозвища Латын, что в некоторых тюркских языках означает «золото» (ср. татарское «алтын»). Однако прямой переход «алтын» в «латын» фонетически неочевиден, а главное — в русских говорах слово «латынь» было куда употребительнее, чем гипотетическое тюркское заимствование. Поэтому первая версия — о латинском языке или католичестве — выглядит убедительнее.

Сословно фамилия Латын не элитарна: её носители вряд ли относились к дворянству или духовенству. Скорее, это были посадские люди, казаки или крестьяне, получившие прозвище за свою необычную для деревни образованность или за связь с «латинской» верой. В документах XVII–XVIII веков такая фамилия могла фиксироваться у беглых крестьян или служилых людей южных рубежей. Сегодня она остаётся редкой, но её обладатели могут с полным правом считать, что их предок выделялся знанием языка или особым мировоззрением среди односельчан.