Фамилия Леготины образована от прозвища Легота, которое связано с нарицательным «леготь» — «легкость» (в значении веса). Вероятнее всего, прозвище получил худой, малорослый человек. Слово встречается в русской загадке: «На горе горище лежит голенище; в том голенище деготь, леготь, и смерть не далеко (ружье на плече)».

По словообразовательной модели фамилия относится к типичным русским фамилиям на -ин. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Леготин, то есть сын или потомок Леготы. Менее распространённая альтернативная версия связывает основу с диалектным «легота» в значении «льгота, облегчение», но она не находит подтверждения в письменных источниках.

Точное время и место возникновения фамилии Леготин установить сложно: процесс формирования фамилий у крестьян и посадских людей растянулся на несколько столетий. Однако в переписных книгах XVII века встречаются отдельные упоминания однокоренных прозвищ, что позволяет отнести фамилию к достаточно раннему пласту русских родовых именований.

Фамилия Леготин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры, сохранивший в себе редкое слово, которое теперь почти вышло из живого употребления.