Фамилию Лепейко стоит разбирать с её финали — суффикс -к-о. Это типичная украинская или белорусская модель образования фамилий от прозвищ или имён, где -к-о выступает уменьшительным или принадлежностным суффиксом (как в фамилиях Шевченко, Коваленко). Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Лепéйко.

Основа «Лепей» неочевидна. Самое прямое объяснение — от глагола «лепить». В таком случае Лепей — это прозвище мастера-лепщика, гончара или, в переносном смысле, человека, который «лепит» что-то руками, например, скульптора или строителя из глины. Однако в говорах «лепей» могло означать и нечто иное: в некоторых диалектах «лепый» — это красивый, статный. Тогда прозвище Лепей дали бы видному, ладному человеку.

Спорная, но возможная версия — связь с личным именем. В старых польских и украинских записях встречается имя Лепей (Lepiej) как вариант от Лев или от греческого Леонтий, но это скорее единичные случаи, чем правило. Более надёжно считать фамилию профессиональной.

География фамилии Лепейко — почти исключительно западные и центральные регионы Украины, а также юг Беларуси. Встречается она нечасто, что говорит о её локальном бытовании. Если предки носили эту фамилию, они, вероятнее всего, были ремесленниками, связанными с глиной или строительством, либо просто получили прозвище по какой-то приметной черте. Сословных рамок у такой фамилии нет — её могли носить и казаки, и крестьяне, и мещане.