Фамилия Лепейкова хранит память о занятии или особенности предка. Её основа — прозвище Лепей, которое связывают с глаголом «лепить». Чаще всего так называли человека, работавшего с глиной: гончара или строителя мазанок — домов из глины, сырцового кирпича или дерева, обмазанного глиной. Впрочем, у прозвища мог быть и другой оттенок: Лепеем иногда называли того, кто всё делал излишне поспешно, на скорую руку.

Сама фамилия — поздняя, русифицированная. Форма Лепейкова говорит о том, что предки фамилии переехали в Россию из другой языковой среды, где прозвище Лепей бытовало без родового суффикса. На русской почве к нему добавили типичный суффикс -ов (в женском варианте -ова), который закрепил принадлежность к роду. Так прозвище, когда-то данное одному человеку, стало наследственным именем целой семьи.

Суффикс -ей в основе Лепей — редкий для русских прозвищ. Он скорее характерен для западно- и южнославянских языков, что указывает на возможные миграционные пути рода. Фамилия Лепейкова встречается нечасто, что делает её особенно ценной для тех, кто ищет свои корни: каждый документ или устное предание могут пролить свет на то, откуда именно пришли предки и каким ремеслом кормились.