Фамилия Ликанина — относительно редкая, и её происхождение напрямую связано с женским личным именем или прозвищем. В основе, скорее всего, лежит имя Ликанья, которое в русской традиции могло быть производной формой от канонического имени Ангелина (через цепочку Ангелина → Геля → Лика → Ликанья) или от имени Галина (Галя → Лика). Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: «чей сын?» — «Ликанин», то есть потомок человека по имени Ликаня. В русской ономастике фамилии на -ин образуются от основ на -а/-я, поэтому для женщины форма «Ликанина» — это притяжательное прилагательное, а для мужчины — «Ликанин».

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с прозвищем Ликань. В северо-западных и сибирских говорах «ликать» — значит кричать, звать, кликать. Ликаней могли прозвать крикливого человека или того, кто работал зазывалой, глашатаем. Однако эта гипотеза слабее, так как глагол «ликать» имеет локальное распространение, а имя Ликанья фиксируется в источниках XVII–XVIII веков.

Географически фамилия встречается разрозненно, без явного гнезда. Её носители живут в центральной России и Поволжье, но это не массовая фамилия. Интересно, что в некоторых переписях XIX века записаны крестьяне с фамилией Ликанины, что указывает на недворянское происхождение — основная масса таких фамилий принадлежала крепостным и государственным крестьянам. Дворянских родов с этой фамилией нет.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями (Ликанов, Ликин), то Ликанина стоит особняком: суффикс -ин и окончание -а выдают женский род в начальной форме, что типично для фамилий, закрепившихся через женскую линию (например, когда вдова или дочь получала фамилию от отца, но в женском варианте). В современном употреблении мужская форма — Ликанин, женская — Ликанина.